农用车交通肇事吊销驾照，会影响C1证。根据《道路交通安全法》，构成犯罪需吊销驾照，C1证若关联也将受影响，可能面临降级或吊销，严重时无法合法驾驶相应车辆。
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会影响C1证。具体操作：1.若事故构成犯罪，需接受吊销驾照处罚，C1证或降级；2.对处罚有异议，可申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身权益；3.若吊销C1证，需重新学习考试恢复，期间不得驾驶。
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农用车交通肇事，处理方式有多种。常见为接受处罚、申请复议或诉讼。根据事故责任、后果选择，若无疑义则接受，有异议可申请复议或提起行政诉讼。